| Projeto | Título | Datas | Programa, parceiros |
| Inovamar | Pacto da Bioeconomia Azul | 2022-2025 | PRR | > 80 parceiros |
| ApR-TEC | Soluções tecnológicas para garantia da qualidade microbiológica da água para reutilização | 2021-2023 | P2020 | AST-Ambiente / ESB-UCP / WEDOTECH |
| cLabel+ | Alimentos inovadores “clean label” naturais, nutritivos e orientados para o consumidor | 2020-2023 | PT2020 | 20 parceiros |
| FarmaSense | Inovações na deteção e tratamento de fármacos em águas residuais | 2019-2022 | P2020 | AST-Ambiente / ISEP / WEDOTECH |
| 4Cs | Consumer Cross Cultural Context – Avaliação intercultural de vinhos e produtos tradicionais portugueses | 2018-2021 | P2020 | Sense Test, Sogevinus, Universidade do Porto – Faculdade de Ciências, WEDOTECH |
| HBioS_Demo | Projeto de Demonstração à escala industrial da tecnologia HBioS | 2015-2016 | P2020 | EFACEC / WEDOTECH |
| iCanSea | Desenvolvimento de conservas com integração de algas da costa portuguesa | 2015-2017 | P2020 | La Gondola / ISEP / WEDOTECH |
| OptimOdour | Eficiência energética em ETARs | 2015-2017 | P2020 | Guiatel / WEDOTECH |
| Naturbel | Sabonetes e produtos cosméticos naturais tendo por base matérias típicas de Portugal | 2013-2015 | QREN | Castelbel / ISEP / WEDOTECH |
| OdorTech | Afirmação da Biofiltração como Melhor Tecnologia Disponível para o Tratamento de Odores | 2013-2015 | QREN | Eurofins / ISEP / WEDOTECH |
| HBioS | Inovações Biotecnológicas na Remoção de H2S presente no Biogás | 2012-2015 | QREN | EFACEC e UCP/ESB / WEDOTECH |
| iCOD | Tecnologias inovadoras para valorização de subprodutos do processamento do bacalhau | 2010-2012 | QREN | PASCOAL / ESB / WEDOTECH |
| OBiT | Tratamento Biológico de Odores | 2010-2012 | QREN | UCP/ESB | WEDOTECH |
| InSolEx | Soluções inovadoras para extração de compostos naturais de elevado valor acrescentado | 2006-2010 | Marie Curie RTN – EU | vários parceiros |
| BioHiTec | Inovadores Bioreactores de Fase Gasosa para COVs | 2006-2007 | NEOTEC | WEDOTECH |
